Ученые открыли уникальные фрагменты ДНК бактерий в слюне человека

Группа исследователей из Токийского университета обнаружила в ротовой полости человека новые большие фрагменты ДНК, известные как иноклы, которые существуют отдельно от основной генетической информации. Результаты их работы были опубликованы в журнале Nature Communications. Ученые провели анализ большого количества слюнных образцов от добровольцев. Используемые стандартные методы секвенирования не позволяли увидеть целые иноклы, так как они обычно разбивают ДНК на мелкие фрагменты. Для решения этой проблемы команда применила технологии секвенирования длинных фрагментов и специальные методы для удаления человеческой ДНК из образцов.



В ходе исследований ученым удалось впервые собрать полные геномы иноклов, связанных с бактериями Streptococcus salivarius. Средний размер этих иноклов составил 350 килобаз, что делает их одними из самых крупных внехромосомных элементов в микробиоме человека. Ученые отметили, что обычные плазмиды обычно имеют размеры всего лишь в десятки килобаз. Иноклы содержат гены, которые отвечают за защиту от окислительного стресса, восстановление ДНК и адаптацию к внешним воздействиям. По предварительным оценкам, примерно 74% людей могут быть носителями этих элементов.

Исследователи намерены разработать методы для культивирования бактерий с иноклами, чтобы глубже изучить их функции, способы передачи между людьми и возможное влияние на различные заболевания, такие как кариес и болезни десен. В будущем команда планирует сочетать лабораторные эксперименты с компьютерным моделированием для дальнейшего исследования. Также ранее был обнаружен редкий вариант гена, связанный с болезнью Альцгеймера.

Читайте также: