Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа

Новосибирские биологи совместно с международными коллегами секвенировали и полностью упорядочили геном масайского жирафа — самого высокого наземного животного в мире. Результаты работы опубликованы в журнале GigaScience.


Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново расшифровали фрагменты генома жирафа и собрали их в последовательности, соответствующие хромосомам. Масайский жираф относится к исчезающим видам, и его особенности делают геном особенно ценным для науки. Новосибирские специалисты из НГУ и Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН применяли современные методы секвенирования и сборки данных для оптимизации генома. Публикация в GigaScience (импакт-фактор — 7,267) демонстрирует значимость работы в области биологических исследований.

"В мире сейчас реализуются несколько проектов по новому секвенированию геномов позвоночных. От России в них участвует только наш коллектив. На первых этапах обычно выбирают «знаковых» животных — жираф стал одним из таких объектов", — отметил руководитель направления ИМКБ СО РАН, инженер лаборатории структурной, функциональной и сравнительной геномики Факультета естественных наук НГУ, доктор биологических наук Александр Графодатский.

Масайский жираф отличается уникальной анатомией и физиологией, что давно привлекает внимание ученых. Исследование генома помогает понять молекулярные основы адаптаций этого вида и облегчает эволюционный анализ других жвачных животных.

"Сборка генома масайского жирафа изначально представляла собой «кучу рваного текста» без начала и конца, как это часто бывает с геномами других видов. После четырёх лет работы получилась «книга про жирафа» с последовательностями около 20 тысяч генов. Следующий шаг — выяснить, как эти гены функционируют, например, какие изменения обеспечивают работу сердца на такой высоте без инфарктов. Кроме того, жирафы — отдельная группа парнокопытных, и мы детально установили отличия их генома от коров, оленей и других изученных видов", — рассказал Александр Графодатский.

В ИМКБ СО РАН хранится уникальная коллекция живых клеток сотен животных, включая представителей африканской фауны. Создание сборки генома масайского жирафа формирует важный ресурс для сохранения вида, численность которого за последние годы снизилась на 52%.

Читайте также: